机械设计制造及其自动化专业始于1993年创建的农用机电专科专业，2003年开始本科招生，迄今已有近20年的本科招生历史。2011年获批国家级卓越工程师教育培养计划专业，2017年获批安徽省品牌（特色）专业，2018年获批为安徽省“六卓越、一拔尖”卓越人才培养计划专业，2019年获批安徽省一流本科专业建设点，2021年获批机械硕士学位授权点。